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通常含盐量为苦咸水范围的某些井水呈还原态，典型特点是含有二价的铁和锰，有时还会存在硫化氢和氨。如果对这类
水源进行氯化处理，或当水中含氧量超过5mg/L 时，Fe2+将转化成Fe3+，形成难溶性的胶体氢氧化物颗粒。铁和锰的氧化反 应如下：
4Fe(HCO3) 2 + O2 + 2H2O 4Fe(OH) 3 + 8 CO2
4Mn(HCO3) 2 + O2 + 2H2O 4Mn(OH) 3 + 8 CO2
由于铁的氧化在很低的pH 值时就会发生，因而出现铁污染的情况要比锰污染的情况更多，即使SDI 小于5，RO 进水的
铁含量低于0.1mg/L，仍会产生铁污染问题。碱度低的进水铁离子含量要高，这是因为FeCO3的溶解度会限制Fe2+的浓度。
处理这类水源的一种方法是防止其在整个RO 过程中与空气和任何氧化剂如氯的接触。低pH 值有利于延缓Fe2+的氧化，
当pH<6，氧含量<0.5mg/l 时，最大允许Fe2+浓度4mg/L，另一方法是用空气、Cl2 或KMnO4 氧化铁和锰，将所形成的氧化物通 过介质过滤器除去，但需要注意的是，由硫化氢氧化形成的胶体硫可能难以由过滤器除去，在介质过滤器内添加氧化剂通过 电子转移氧化Fe2+，即可一步同时完成氧化和过滤。
海绿石就是这样一种粒状过滤介质，当其氧化能力耗尽时，它可通过KMnO4的氧化来再生，再生后必须将残留的KMnO4
完全冲洗掉，以防止对膜的氧化破坏。当原水中含Fe2+的量小于2mg/L 时，可以采用这一处理方法，如原水中含更高的Fe2+ 时，可在过滤器进水前连续投加KMnO4，但是在这种情况下，必须采取措施例如安装活性炭滤器以保证没有高锰酸钾进入膜 元件内。
Birm 过滤也可以有效地用于从RO/NF 进水中去除Fe2+，Birm 是一种硅酸铝基体上涂有二氧化锰的过滤介质，它对溶解氧
和二价铁之间的反应起催化作用，使可溶性二价铁和锰形成沉淀，并且通过滤器反洗可将这些沉淀冲出滤器。由于该过程
pH 将升高，可能会发生LSI 值变化，因而要预防滤器和RO/NF 系统内出现CaCO3沉淀。